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科學(xué)家發(fā)現(xiàn)人類基因組進(jìn)化“指紋
“人類基因組計(jì)劃”顯示,人類30億個(gè)堿基對(duì)中只有很少一部分用于編碼蛋白質(zhì)。那么人類基因組剩余的部分在起著什么作用?它們是否只是之前遺傳事件的殘余?
美國(guó)科學(xué)家近日研究 發(fā)現(xiàn),遺傳信息轉(zhuǎn)變?yōu)榈鞍踪|(zhì)的過程中會(huì)留下遺傳“指紋”,這些“指紋”甚至?xí)霈F(xiàn)在未參與蛋白編碼過程的序列中。研究人員估計(jì)這些“指紋”至少影響到了三分之一的基因組,這表明雖然大部分DNA不參與編碼蛋白,但是它們對(duì)在進(jìn)化期間保持持續(xù)性具有重要的生物學(xué)作用。相關(guān)論文4月7日在線發(fā)表于美國(guó)《國(guó)家科學(xué)院院刊》(PNAS)上。
生物學(xué)家認(rèn)為,不同物種的基因組有些相關(guān)序列相差很大,這是進(jìn)化導(dǎo)致的突變所致;而有些相關(guān)序列所含基因相似,這些序列稱為保守序列(conserved sequences),這些序列中基因的突變會(huì)使物種無(wú)法存活。生物學(xué)家因此將保守序列視為生物學(xué)重要性的標(biāo)記。
要檢測(cè)保守性,研究人員需要在兩個(gè)物種中找到匹配的序列。這對(duì)編碼序列來(lái)說相對(duì)簡(jiǎn)單,而對(duì)非編碼序列來(lái)說則要困難許多。即使在一個(gè)基因之內(nèi),編碼目標(biāo)蛋白的序列也通常會(huì)點(diǎn)綴著“內(nèi)含子”(introns),這些內(nèi)含子在蛋白質(zhì)形成之前會(huì)被切除下來(lái)。
之前,科學(xué)家猜測(cè)內(nèi)含子中的突變不會(huì)影響最后的蛋白質(zhì),所以它們就簡(jiǎn)單地積累起來(lái)。而在最新的研究中,美國(guó)冷泉港實(shí)驗(yàn)室和芝加哥大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),即使在這些區(qū)域,進(jìn)化也會(huì)拒絕一些類型的突變。研究負(fù)責(zé)人、冷泉港實(shí)驗(yàn)室教授Michael Zhang認(rèn)為,雖然選擇是微弱的,但就對(duì)存活的影響來(lái)說,“內(nèi)含子不是中立的”。
接下來(lái)的研究發(fā)現(xiàn),必須有某種信號(hào)序列(signal sequences)出現(xiàn)在內(nèi)含子中,它才能被很好地剪切,否則會(huì)帶來(lái)潛在的致命效果。其它一些序列同樣得以保存在保留區(qū)域內(nèi)。
研究人員還發(fā)現(xiàn)了內(nèi)含子和編碼區(qū)對(duì)不同堿基的偏愛。這些區(qū)域一共構(gòu)成三分之一多的基因組,經(jīng)歷著進(jìn)化的選擇壓力。這一發(fā)現(xiàn)支持了其他一些研究的結(jié)果,即雖然大多數(shù)DNA不編碼蛋白質(zhì),它們中的大部分卻具有重要的生物學(xué)意義。
除了證明了剪接怎樣影響遺傳進(jìn)化之外,此次研究還確定了一些可能的信號(hào)序列,其中一些為過去已知,另一些則是全新發(fā)現(xiàn)。論文合作者、冷泉港實(shí)驗(yàn)室教授Adrian Krainer說:“令人激動(dòng)的是,將來(lái)要用實(shí)驗(yàn)方法檢測(cè)這些預(yù)測(cè)元素是否是真的!
美國(guó)科學(xué)家近日
生物學(xué)家認(rèn)為,不同物種的基因組有些相關(guān)序列相差很大,這是進(jìn)化導(dǎo)致的突變所致;而有些相關(guān)序列所含基因相似,這些序列稱為保守序列(conserved sequences),這些序列中基因的突變會(huì)使物種無(wú)法存活。生物學(xué)家因此將保守序列視為生物學(xué)重要性的標(biāo)記。
要檢測(cè)保守性,研究人員需要在兩個(gè)物種中找到匹配的序列。這對(duì)編碼序列來(lái)說相對(duì)簡(jiǎn)單,而對(duì)非編碼序列來(lái)說則要困難許多。即使在一個(gè)基因之內(nèi),編碼目標(biāo)蛋白的序列也通常會(huì)點(diǎn)綴著“內(nèi)含子”(introns),這些內(nèi)含子在蛋白質(zhì)形成之前會(huì)被切除下來(lái)。
之前,科學(xué)家猜測(cè)內(nèi)含子中的突變不會(huì)影響最后的蛋白質(zhì),所以它們就簡(jiǎn)單地積累起來(lái)。而在最新的研究中,美國(guó)冷泉港實(shí)驗(yàn)室和芝加哥大學(xué)的研究人員發(fā)現(xiàn),即使在這些區(qū)域,進(jìn)化也會(huì)拒絕一些類型的突變。研究負(fù)責(zé)人、冷泉港實(shí)驗(yàn)室教授Michael Zhang認(rèn)為,雖然選擇是微弱的,但就對(duì)存活的影響來(lái)說,“內(nèi)含子不是中立的”。
接下來(lái)的研究發(fā)現(xiàn),必須有某種信號(hào)序列(signal sequences)出現(xiàn)在內(nèi)含子中,它才能被很好地剪切,否則會(huì)帶來(lái)潛在的致命效果。其它一些序列同樣得以保存在保留區(qū)域內(nèi)。
研究人員還發(fā)現(xiàn)了內(nèi)含子和編碼區(qū)對(duì)不同堿基的偏愛。這些區(qū)域一共構(gòu)成三分之一多的基因組,經(jīng)歷著進(jìn)化的選擇壓力。這一發(fā)現(xiàn)支持了其他一些研究的結(jié)果,即雖然大多數(shù)DNA不編碼蛋白質(zhì),它們中的大部分卻具有重要的生物學(xué)意義。
除了證明了剪接怎樣影響遺傳進(jìn)化之外,此次研究還確定了一些可能的信號(hào)序列,其中一些為過去已知,另一些則是全新發(fā)現(xiàn)。論文合作者、冷泉港實(shí)驗(yàn)室教授Adrian Krainer說:“令人激動(dòng)的是,將來(lái)要用實(shí)驗(yàn)方法檢測(cè)這些預(yù)測(cè)元素是否是真的!
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